Abstract
Objective: This study aims to determine the antibiotic susceptibility and distribution of community-acquired microorganisms obtained from urine samples of patients admitted to our clinic in Diyarbakır, and also detect the ratio of extended spectrum beta-lactamase producing E.coli and Klebsiella strains in urine samples, and identify the antibiotics that can be used for the empiric treatment by investigating the susceptibility of extended spectrum beta-lactamase positive strains.Methods: Patients admitted to the pediatric polyclinic of our hospital between the dates 1 January-31 December were included in the study. 1167 urine samples sent to Microbiology Laboratory were examined. E.coli and Klebsiella spp. strains isolated from the urine cultures were identified with traditional methods and the Biomerium Vitek-2 compact system. Antibiotic susceptibility tests were performed in accordance with the recommendations of Clinical and Laboratory Standards Institute using Biomerium Vitek-2 compact system.Results: 959 E.coli from 1167 urine samples and other microorganisms from 26 of 182 Klebsiella spp. were isolated. Extended spectrum beta-lactamase production was detected in 445 (46.4%) of E.coli strains and in 72 (39.5%) of Klebsiella spp.strains. Amicasin resistance was determined as 9.4% in Extended spectrum beta-lactamase positive E.coli strains, while amicasin resistance was detected as 11% in Extended spectrum beta-lactamase positive Klebsiella spp. strains.Conclusion: Resistance development against the antibiotics has been increasingly observed in most of the microorganisms that cause urinary tract infection. We are in the opinion that this study is important for our hospital, as urinary tract infection factors vary according to centers
References
- Marild S, Jodal U. Incidence rate of first-time symptomatic
- urinary tract infection in children under 6 years of age. Acta
- Paediatr 1998;87:549-552.
- Shaikh N, Morone NE, Bost JE, Farrell MH. Prevalence of
- urinary tract infection in childhood: a meta-analysis. Pediatr Infect Dis J 2008;27:302-308.
- Lamcorbe J. Urinary tract infection in children. BMJ
- ;319:1173-1175.
- Zaki M, Mutari GA, Badawi M, Ramadan D, Al deen Hanafy.
- E.Vesicoureteric reflux in Kuwaiti children with first febrile
- urinary tractinfection. Pediatr Nephrol 2003;18:898-901.
- Sirin A, Emre S, Alpay H, Nayir A, Bilge I, Tanman F. Etiologyof chronic renal failure in Turkish children. Pediatr
- Nephrol 1995;9:549-552.
- Paterson Dl, Bonomo RA. Extended-spectrum ß-lactamases:
- a clinical update. Clin Microbiol Rev 2005;18:657-686.
- Deveci Ö, Yula E, Tekin A. İdrar kültürlerinden izole edilen
- genişlemiş spektrumlu beta laktamaz sıklığı ve antinbiyotik
- direnci. J Clin Exp Invest 2010;1:182-186.
- Arslan H, Azap OK, Ergonul O, Timurkaynak F. Urinary
- Tract Infection Study Group: Risk factors for ciprofloxacin resistance among Escherichia coli strains isolated from
- community-acquired urinary tract infections in Turkey. J
- Antimicrob Chemother 2005;56:914-918.
- Kahlmeter G, Poulsen HO. Antimicrobial susceptibility of
- Escherichia coli from community-acquired urinary tract
- infections in Europe: the ECO•SENS study revisited. Int J
- Antimicrob Agents 2012;39:45-51.
- Demiraslan H, Demir NA, Kölgelier S. Adıyaman’da Enterobacteriaceae ailesindeki genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) oranı ve antibiyotik duyarlılıkları. lora
- ;15:112-117.
- Karaoğlan İ, Zer Y, Namıduru M. GSBL pozitif Escherichia
- coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında tigesiklinin in vitro etkinliği. ANKEM Derg 2008;22:69-71.
- Yılmaz N, Ağuş N, Köse Ş, et al. Geniş spektrumlu beta-laktamaz salgılayan Escherichia coli ve Klebsiellapneumoniae suşlarının ertapenem ve diğer antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009;39:80-84.
- Göker G, Kaya I, Aydın D, et. al. Üriner sistemden izole
- edilen Escherichia coli, Klebsiella ve Enterokok cinsi bak-terilerde fosfomisin duyarlılığının araştırılması. ANKEM Derg 2007;21:219-222.
- Kart Yaşar K, Pehlivanoğlu F, Şengöz G. Alternatif tedavi seçeneği olarak fosfomisinin komplike üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen GSBL pozitif Escherichia colisuşlarına etkinliği. ANKEM Derg 2011;25:12-16.
- Bayram Y, Eren H, Berktaş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni. ANKEM Derg
- ;25:232-236.
- Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem enfeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. ANKEM Derg 2009;23:172-176.17. Güdücüoğlu H, Baykal S, İzci H, et al. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotiklere direnci. ANKEM Derg 2007;21:155-160.
- Calbo E, Romani V, Xercavins M, et al. Risk factors for
- community-onset urinary tract infections due to Escherichia coli
- harbouring extended-spectrum beta- lactamases. J Antimicrob Chemother 2006;57:780-783.
- Yetkin G, Kuzucu Ç, Çalışkan A. İdrarda üreyen Escherichia coli’lerin geniş spektrumlu beta laktamazlar yönünden
- irdelenmesi. İnönü Üniv Tıp Fak Derg 2006;13:249-252.
- Çiçek AÇ, Köksal ZŞ, Ertürk A, et al. Rize 82. yıl devlet hastanesi’nde çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia oli
- ve Klebsiella suşlarının genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz retimleri ve antimikrobiklere direnç oranları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2011;41:149-154.
- Duman Y, Güçlüer N, Serindağ A, et al. Escherichia colisuşlarında antimikrobiyal duyarlılık ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) varlığı. Fırat Tıp Derg
- ;15:197-200.
- Temiz H, Akkoç H, Gül K. Laboratuarımızda İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Gram Negatif Bakterilerde Antibiyo
- tiklere Direnci. Dicle Tıp Dergisi 2008;3:234-239.
Çocuklarda idrar örneklerinden saptanan toplum kaynaklı gram negatif mikroorganizmaların dağılımı ve 2013 yılı antibiyotik dirençleri
Abstract
Amaç: Bu çalışmada Diyarbakır bölgesinde polikliniğe başvuran hastaların idrar örneklerinden elde edilen toplum kaynaklı gram negative mikroorganizmaların dağılımı ve antibiyotik dirençlerini belirlemek. İdrar örneklerdeki geniş spektrumlu beta-laktamaz üreten gram negative suşlarının oranını saptamak ve geniş spektrumlu beta-laktamaz pozitif suşların çeşitli antibiyotiklere dirençlerini araştırarak ampirik tedavide kullanılabilecek antibiyotikleri belirlemek amaçlanmıştır.
Yöntemler: 1 Ocak 2013–31 Aralık 2013 tarihleri arasında hastanemizin çocuk polikliniğine başvuran hastalar alındı. Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen 1167 idrar yolu örneği değerlendirildi. İdrar kültürlerinden izole edilen gram negative suşlarının tanımlanması ve antimikrobik duyarlılık testleri Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) önerileri doğrultusunda Biomerium Vitek-2 compact sistemle yapıldı.
Bulgular: Çalışma süresince 1167 idrar örneğinden 959 E.coli ve 182 Klebsiella spp. 26’sında diğer mikroorganizmalar izole edildi. E.coli suşlarının 445’inde (%46,4), Klebsiella spp.suşlarının 72’inde (%39,5) geniş spektrumlu beta-laktamaz üretimi saptanmıştır. Geniş spektrumlu beta-laktamaz-pozitif E.coli suşlarında amikasin direnci ise %9,4 iken GSBL-pozitif Klebsiella spp. suşlarında amikasin direnci %11 olarak belirlendi.
Sonuç: İdrar yolu enfeksiyonlarına yol açan mikroorganizmaların bir çoğunda antibiyotiklere karşı artan oranlarda direnç geliştiği görülmektedir. İdrar yolu enfeksiyon etkenlerinin antibiyotik direnç oranları merkezlere göre farklılıklar göstermesi nedeniyle hastanemiz için bu çalışmanın önemli olduğunu düşünmekteyiz.
Anahtar kelimeler: Antibiyotik direnci, çocuk, toplum kaynaklı idrar yolu enfeksiyonu
References
- Marild S, Jodal U. Incidence rate of first-time symptomatic
- urinary tract infection in children under 6 years of age. Acta
- Paediatr 1998;87:549-552.
- Shaikh N, Morone NE, Bost JE, Farrell MH. Prevalence of
- urinary tract infection in childhood: a meta-analysis. Pediatr Infect Dis J 2008;27:302-308.
- Lamcorbe J. Urinary tract infection in children. BMJ
- ;319:1173-1175.
- Zaki M, Mutari GA, Badawi M, Ramadan D, Al deen Hanafy.
- E.Vesicoureteric reflux in Kuwaiti children with first febrile
- urinary tractinfection. Pediatr Nephrol 2003;18:898-901.
- Sirin A, Emre S, Alpay H, Nayir A, Bilge I, Tanman F. Etiologyof chronic renal failure in Turkish children. Pediatr
- Nephrol 1995;9:549-552.
- Paterson Dl, Bonomo RA. Extended-spectrum ß-lactamases:
- a clinical update. Clin Microbiol Rev 2005;18:657-686.
- Deveci Ö, Yula E, Tekin A. İdrar kültürlerinden izole edilen
- genişlemiş spektrumlu beta laktamaz sıklığı ve antinbiyotik
- direnci. J Clin Exp Invest 2010;1:182-186.
- Arslan H, Azap OK, Ergonul O, Timurkaynak F. Urinary
- Tract Infection Study Group: Risk factors for ciprofloxacin resistance among Escherichia coli strains isolated from
- community-acquired urinary tract infections in Turkey. J
- Antimicrob Chemother 2005;56:914-918.
- Kahlmeter G, Poulsen HO. Antimicrobial susceptibility of
- Escherichia coli from community-acquired urinary tract
- infections in Europe: the ECO•SENS study revisited. Int J
- Antimicrob Agents 2012;39:45-51.
- Demiraslan H, Demir NA, Kölgelier S. Adıyaman’da Enterobacteriaceae ailesindeki genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) oranı ve antibiyotik duyarlılıkları. lora
- ;15:112-117.
- Karaoğlan İ, Zer Y, Namıduru M. GSBL pozitif Escherichia
- coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında tigesiklinin in vitro etkinliği. ANKEM Derg 2008;22:69-71.
- Yılmaz N, Ağuş N, Köse Ş, et al. Geniş spektrumlu beta-laktamaz salgılayan Escherichia coli ve Klebsiellapneumoniae suşlarının ertapenem ve diğer antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009;39:80-84.
- Göker G, Kaya I, Aydın D, et. al. Üriner sistemden izole
- edilen Escherichia coli, Klebsiella ve Enterokok cinsi bak-terilerde fosfomisin duyarlılığının araştırılması. ANKEM Derg 2007;21:219-222.
- Kart Yaşar K, Pehlivanoğlu F, Şengöz G. Alternatif tedavi seçeneği olarak fosfomisinin komplike üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen GSBL pozitif Escherichia colisuşlarına etkinliği. ANKEM Derg 2011;25:12-16.
- Bayram Y, Eren H, Berktaş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni. ANKEM Derg
- ;25:232-236.
- Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem enfeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. ANKEM Derg 2009;23:172-176.17. Güdücüoğlu H, Baykal S, İzci H, et al. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotiklere direnci. ANKEM Derg 2007;21:155-160.
- Calbo E, Romani V, Xercavins M, et al. Risk factors for
- community-onset urinary tract infections due to Escherichia coli
- harbouring extended-spectrum beta- lactamases. J Antimicrob Chemother 2006;57:780-783.
- Yetkin G, Kuzucu Ç, Çalışkan A. İdrarda üreyen Escherichia coli’lerin geniş spektrumlu beta laktamazlar yönünden
- irdelenmesi. İnönü Üniv Tıp Fak Derg 2006;13:249-252.
- Çiçek AÇ, Köksal ZŞ, Ertürk A, et al. Rize 82. yıl devlet hastanesi’nde çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia oli
- ve Klebsiella suşlarının genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz retimleri ve antimikrobiklere direnç oranları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2011;41:149-154.
- Duman Y, Güçlüer N, Serindağ A, et al. Escherichia colisuşlarında antimikrobiyal duyarlılık ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) varlığı. Fırat Tıp Derg
- ;15:197-200.
- Temiz H, Akkoç H, Gül K. Laboratuarımızda İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Gram Negatif Bakterilerde Antibiyo
- tiklere Direnci. Dicle Tıp Dergisi 2008;3:234-239.
Details
| Primary Language | Turkish |
|---|---|
| Journal Section | Research Articles |
| Authors | |
| Publication Date | July 8, 2015 |
| Submission Date | July 8, 2015 |
| Published in Issue | Year 2015 Volume: 42 Issue: 2 |