Abstract
Aim. Although anaerobic bacteria are a group of bacteria that can cause significant pathological changes, they are are frequently overlooked due to the difficulties in culturing and isolation. This study aims to investigate the distributions of anaerobic bacteria isolated from the specimens sent to the Microbiology Laboratory of the Cumhuriyet University School of Medicine between the years 2006-2013 based on a preliminary diagnosis of anaerobic infection. Methods. This study includes 543 samples properly collected from various clinics, these samples were retrospectively examined using laboratory records. Results. While there was no growth in 409 (75.3%) of the study samples, various anaerobic bacteria were grown on 134 (24.6%) samples. Our study found the highest growth rate (29.9%) to be in Bacteroides spp. among the anaerobic bacteria isolated in our study, followed by Peptopstreptococcus spp. (23.1%), and Propionibacterium spp. (20.2%). Conclusions. As a result, although growing anaerobic bacteria is difficult, time-consuming and more expensive, it is possible to isolate a significant amount of anaerobic bacteria as infectious agents when clinical samples were properly collected and sent. We consider that describing anaerobic bacteria will allow for a more accurate treatment of such infections. We think that the local data obtained with this study will offer benefits in following and treating infections caused by anaerobic bacteria and contribute to the current literature.
References
- Torun MM. Anaerob bakteri infeksiyonları: Kültürde sorunlar, Klimik Derg 2003; 16: 25-8.
- Görenek L. Anaerob bakteri infeksiyonlarında klinik sorunlar, Klimik Derg 2003; 16: 36-8.
- Ulusoy S, Leblecioğlu H. Önemli ve sorunlu anaerob bakteri infeksiyonları; Anaerob infeksiyonlar ve laboratuvar tanısı, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara 2005: Ustaçelebi Ş. Temel ve Klinik Mikrobiyoloji: Anaerob bakteriler, Güneş Tıp Kitabevi, Ankara 1999: 612-5.
- Naidoo S, Perovic O, Richards GA, Duse AG. Clinically significant anaerobic bacteria isolated from patients in a South African academic hospital: Antimicrobial susceptibility testing, S Afr Med J 2011; 101: 732-4.
- Doğan M, Baysal B. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen anaerob bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, Mikrobiyol Bült 2010; 44: 211-9.
- Bennion RS, Baron EJ, Thompson JE, Downes J, Summanen P, Talan DA et al. The bacteriology of gangrenous and perforated appendicitis-revisited, Ann Surg 1990; 211: 165-71.
- Durmaz B, Taştekin N. Anaerob infeksiyon ön tanılı hastaların klinik örneklerinden izole edilen anaerob bakteriler, Mikrobiyol Bült 1997; 31: 13-20. Ercis S, Tunçkanat F, Hasçelik G. Anaerobik infeksiyon şüpheli hastalardan izole edilen anaerob bakteriler, Mikrobiyol Bült 2005; 39: 447-54.
- Şengöz G, Yaşar K, Berzeg D, Yıldırım F, Şengöz A, Elmi Ş ve ark. Klinik örneklerden izole edilen anaerob bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005; 35: 107-13.
- Kiremitçi A, Türkkan AA, Akgün Y, Durmaz G, Kaşifoğlu N. Klinik örneklerden anaerob bakterilerin soyutlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, Ankem Derg 2008; 22: 132-44.
- Le Moal G, Landron C, Grollier G, Bataille B, Roblot F, Nassans P et al. Characteristics of brain abscess with isolation of anaerobic bacteria, Scand J Infect Dis 2003; 35: 318-21.
- Brook I. Aeropic and anaerobic bacteriology of intracranial abscesses. Pediatr Neurol 1992; 8: 210-4.
- Bozkurt H, Güdücüoğlu H, Bayram Y, Gülmez S, Kutulay N, Bozkurt EN ve ark. Klinik örneklerden izole edilen anaerob bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları, Van Tıp Derg 2004; 11: 85-91.
- Bahar H, Torun MM, Demirci M, Sever N, İstanbullu A. Yara infeksiyonlarında anaerob bakterilerin dağılımı, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2003; 33: 42-6.
- Bowler PG, Duerden BI, Armstrong DG. Wound microbiology and associated approaches to wound management. Clin Microbiol Rev 2001; 14: 244-69.
- Brook I, Frazier H. Aerobic and anerobic microbiology in intra-abdominal infections associated with diverticulitis, J Med Microbiol 2000; 49: 827-30.
- Mosdell DM, Morris DM, Fry DE. Peritoneal cultures and antibiotic therapy in pediatric perforated appendicitis. Am J Surg 1994; 167: 313-6.
- Bartlett JG. Anaerobic bacterial infections of the lung and pleural space: Clin Infect Dis 1993; 16: 248-55.
Abstract
Özet
Amaç. Anaerob bakteriler önemli patolojilere neden olabilen bakteriler olmasına rağmen kültür ve izolasyonda yaşanan zorluklar nedeniyle sıklıkla gözden kaçmaktadırlar. Bu çalışmada 2006-2013 yılları arasında Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na, anaerob infeksiyon ön tanısı ile gönderilen örneklerden izole edilen anaerob bakterilerin, dağılımlarının incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem. Çalışmaya çeşitli kliniklerden anaeob bakterilerin üretimine uygun şekilde alınarak gönderilen 543 örnek dahil edilmiş, örnekler laboratuvar kayıtlarından geriye dönük olarak incelenmiştir. Bulgular. Çalışılan örneklerin 409’unda (%75,3) üreme görülmezken, 134 örnekte (%24,6) çeşitli anaerob bakteriler üretilmiştir. Çalışmamızda izole ettiğimiz anaerob bakteriler arasında da en fazla üreyen bakterinin Bacteroides spp. (%29,9) olduğu görülürken, ikinci sırada Peptopstreptococcus spp. (%23,1), üçüncü sırada Propionibacterium spp. (%20,2) izole edilmiştir. Sonuç. Anaerob bakterilerin üretilmesi güç, zaman alıcı ve daha pahalı olmasına rağmen klinik örneklerden uygun şekilde alınıp gönderildiğinde önemli miktarda anaerob bakteri infeksiyon etkeni olarak izole edilebilmektedir. Anaerop bakterilerin klinik örneklerden tanımlanması ile anaerop etkenli enfeksiyonların daha isabetli bir şekilde tedavi edilebilmesine olanak sağlanacağı kanaatindeyiz. Çalışmamız sonucunda ortaya koyduğumuz yerel verilerin anaerob bakterilere bağlı infeksiyonların takip ve tedavisinde yarar sağlayarak bu konudaki literatüre katkı sunacağını düşünüyoruz.
Anahtar sözcükler: Anaerob bakteriler, anaerob infeksiyon, bacteroides spp
Abstract
Aim. Although anaerobic bacteria are a group of bacteria that can cause significant pathological changes, they are are frequently overlooked due to the difficulties in culturing and isolation. This study aims to investigate the distributions of anaerobic bacteria isolated from the specimens sent to the Microbiology Laboratory of the Cumhuriyet University School of Medicine between the years 2006-2013 based on a preliminary diagnosis of anaerobic infection. Methods. This study includes 543 samples properly collected from various clinics, these samples were retrospectively examined using laboratory records. Results. While there was no growth in 409 (75,3%) of the study samples, various anaerobic bacteria were grown on 134 (24,6%) samples. Our study found the highest growth rate (29,9%) to be in Bacteroides spp. among the anaerobic bacteria isolated in our study, followed by Peptopstreptococcus spp. (23,1%), and Propionibacterium spp. (20,2%). Conclusions. As a result, although growing anaerobic bacteria is difficult, time-consuming and more expensive, it is possible to isolate a significant amount of anaerobic bacteria as infectious agents when clinical samples were properly collected and sent. We consider that describing anaerobic bacteria will allow for a more accurate treatment of such infections. We think that the local data obtained with this study will offer benefits in following and treating infections caused by anaerobic bacteria and contribute to the current literature.
Keywords: Anaerobic bacteria, anaerobic infection, bacteroides spp
References
- Torun MM. Anaerob bakteri infeksiyonları: Kültürde sorunlar, Klimik Derg 2003; 16: 25-8.
- Görenek L. Anaerob bakteri infeksiyonlarında klinik sorunlar, Klimik Derg 2003; 16: 36-8.
- Ulusoy S, Leblecioğlu H. Önemli ve sorunlu anaerob bakteri infeksiyonları; Anaerob infeksiyonlar ve laboratuvar tanısı, Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara 2005: Ustaçelebi Ş. Temel ve Klinik Mikrobiyoloji: Anaerob bakteriler, Güneş Tıp Kitabevi, Ankara 1999: 612-5.
- Naidoo S, Perovic O, Richards GA, Duse AG. Clinically significant anaerobic bacteria isolated from patients in a South African academic hospital: Antimicrobial susceptibility testing, S Afr Med J 2011; 101: 732-4.
- Doğan M, Baysal B. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen anaerob bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, Mikrobiyol Bült 2010; 44: 211-9.
- Bennion RS, Baron EJ, Thompson JE, Downes J, Summanen P, Talan DA et al. The bacteriology of gangrenous and perforated appendicitis-revisited, Ann Surg 1990; 211: 165-71.
- Durmaz B, Taştekin N. Anaerob infeksiyon ön tanılı hastaların klinik örneklerinden izole edilen anaerob bakteriler, Mikrobiyol Bült 1997; 31: 13-20. Ercis S, Tunçkanat F, Hasçelik G. Anaerobik infeksiyon şüpheli hastalardan izole edilen anaerob bakteriler, Mikrobiyol Bült 2005; 39: 447-54.
- Şengöz G, Yaşar K, Berzeg D, Yıldırım F, Şengöz A, Elmi Ş ve ark. Klinik örneklerden izole edilen anaerob bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005; 35: 107-13.
- Kiremitçi A, Türkkan AA, Akgün Y, Durmaz G, Kaşifoğlu N. Klinik örneklerden anaerob bakterilerin soyutlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, Ankem Derg 2008; 22: 132-44.
- Le Moal G, Landron C, Grollier G, Bataille B, Roblot F, Nassans P et al. Characteristics of brain abscess with isolation of anaerobic bacteria, Scand J Infect Dis 2003; 35: 318-21.
- Brook I. Aeropic and anaerobic bacteriology of intracranial abscesses. Pediatr Neurol 1992; 8: 210-4.
- Bozkurt H, Güdücüoğlu H, Bayram Y, Gülmez S, Kutulay N, Bozkurt EN ve ark. Klinik örneklerden izole edilen anaerob bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları, Van Tıp Derg 2004; 11: 85-91.
- Bahar H, Torun MM, Demirci M, Sever N, İstanbullu A. Yara infeksiyonlarında anaerob bakterilerin dağılımı, Türk Mikrobiyol Cem Derg 2003; 33: 42-6.
- Bowler PG, Duerden BI, Armstrong DG. Wound microbiology and associated approaches to wound management. Clin Microbiol Rev 2001; 14: 244-69.
- Brook I, Frazier H. Aerobic and anerobic microbiology in intra-abdominal infections associated with diverticulitis, J Med Microbiol 2000; 49: 827-30.
- Mosdell DM, Morris DM, Fry DE. Peritoneal cultures and antibiotic therapy in pediatric perforated appendicitis. Am J Surg 1994; 167: 313-6.
- Bartlett JG. Anaerobic bacterial infections of the lung and pleural space: Clin Infect Dis 1993; 16: 248-55.
Details
| Primary Language | Turkish |
|---|---|
| Journal Section | Basic Science Research Articles |
| Authors | |
| Publication Date | June 6, 2014 |
| Published in Issue | Year 2014 |